“中心”将建立一整套完整的管理制度体系，主要包括：组建工程技术中心章程、管理委员会工作职责、技术委员会工作职责、中心日常管理制度、财务管理制度、知识产权使用细则、高级人才引进与管理细则、仪器设备使用制度、开放课题研究基金管理办法等。

中心采用“122”框架。总体目标建立“一个中心、两个体系、两个平台”(见图)。

一个中心：国家植物功能成分利用工程技术研究中心；

两个体系：植物功能成分利用技术研发体系、成果转化与人才培训体系；

两个平台：信息交流平台、成果交易平台。

国家植物功能化成分利用工程技术研究中心运行机制图

工程中心遵循“开放、流动、联合、竞争”的原则，将充分借鉴其它已建和在建工程中心的成功经验，根据自身特点，制定并推行责、权、利统一，有利于人才激励，能保证持续创新和不断提高科技水平的高效率运行机制。逐步形成创新研究、工程化开发、成果推广辐射与产业化的良性循环体系，实现自我发展和不断壮大。管理运行上几个重要的突破与创新如下：

① 工程中心实行管理委员会领导下的主任负责制。工程中心主任对管理委员会负责。

② 工程中心采用人才柔性流动的用人机制，对人才不求所有，但求所用；在不改变人事关系的前提下，突破地域和单位的限制，以项目为核心形成一种互动的人才流动方式，广泛吸引国内优秀人才；使工程中心保持高效精干的人才队伍，实现人才与科研条件和科研项目的最佳结合。

③ 采取设立特殊专家岗位的形式，积极引进国内外技术人才，吸收国外先进技术，加快成果形成与转化的速度。

④ 建立与现代企业相适应的分配制度。工程中心实行工资总额与效益挂钩的自主分配办法。个人收入水平由工程中心的效益和个人的贡献决定。对做出重大贡献、创造明显效益者给予重奖。工程中心的流动人员在工程中心工作期间，与固定人员享有同等待遇。工程中心将积极探索专利、专有技术、成果等生产要素参与分配的新途径。

⑤ 工程中心项目拟采用招投标和专家评审相结合的方式，对研究开发项目实行“定任务、定进度、定经费、定薪金”的管理方式。